项目名称:mRNA实验建库流程与分析流程(polyA 建库)

mRNA实验建库流程与分析流程(polyA 建库)

所属分类:生物信息学分析

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建库流程

  从RNA样品提取到最终数据获得,样品检测、建库、测序等每一环节都会直接影响数据的数量和质量,从而影响后续数据分析的结果。为从源头保证测序数据准确可靠,在数据的所有生产环节都严格把关,从根源上确保高质量数据的产出。建库测序的流程如下所示:

  1. Total RNA 样本检测

  2. RNA 富集

  3. 双链cDNA合成

  4. 末端修复、加A和接头

  5. 片段选择和 PCR 扩增

  6. 文库质检

  7. Illumina测序


分析流程

  RNA-seq的核心是基因表达差异的显著性分析,使用统计学方法,比较两个条件或多个条件下的基因表达差异,从中找出与条件相关的特异性基因,然后进一步分析这些特异性基因的生物学意义,分析过程包括质控、比对、定量、差异显著性分析、功能富集等环节。

图 2