RNA pull - down Model Figures

实验相关产品

名称

品牌

货号

相关链接





RNA   pull-down实验服务

广州赛诚生物科技有限公司



 

实验技术流程

点击 这里 链接至技术文章《RNA pull-down实验技术流程》。

 

实验常见问题

点击 这里 链接至技术文章《RNA pull-down实验常见问题》

 

结果分析

对于一幅RNA pull-down实验结果Figure,应包含位点作用示意图、WB或质谱结果数据分析图,并应在Supplement中补充相关的验证性实验图片,具体如下图所示。

RNA Pull-down model figure.png

RNA 序列: G表示空间构象的变化, AS表示互补链的的二级结构, S表示正义链的二级结构。

 

Figure A

用不同的A、AS、G RNA序列去Pulling Down蛋白符合物,并用不同的KCL浓度梯度洗脱。蛋白抗体NCL hnRNP U hnRNP F RPL7 hnRNP K的单抗进行WB实验。检测A AS G特定区段的结合的蛋白复合物的组分。

RNA Pull-down model figure A.png

Figure B

RNA Pull down后的将蛋白复合物进行质谱实验,发现结合蛋白NCL的肽段。不同RNA构象AASG结合的肽段的不同。

RNA Pull-down model figure B.png

Figure C

通过重组NCLGST上,通过GST Pull down 捕获符合物,进行qRT-PCR检测RNA片段ASSG和细胞组成型表达RNAUnbound RNA GAPDH)。

RNA Pull-down model figure C.png

Figure D

RNA Pull down结果进行SDSPAGE电泳检测。上面四泳道分别为不同的RNA捕获方式,UTP生物素化,无生物素化等。

RNA Pull-down model figure D.png

Supplement

A RNA motif(结构域)注释和motif生物素化结合链霉亲和素。

RNA Pull-down model figure S.A.png

B 在不同的处理条件下(ATP depletion)下进行RNA pulling down后用 CupSmaug 蛋白单抗进行WB检测。

RNA pull - down Model Figure S.B.png

C RNA Pull downRNA探针,在加上Cap帽子结构和不加帽子的情况下捕获的蛋白用elF4G翻译延伸因子 CuP蛋白进行WB。有帽子结构的才能有翻译效应。

RNA pull - down Model Figure S.C.png


目录浏览