染色质免疫沉淀技术 ChIP
实验相关产品
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Pierce™AgaroseChIP Kit | |||
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实验技术流程
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实验常见问题
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结果分析
对于一幅ChIP-qPCR实验结果Figure，应包含位点作用示意图、qPCR结果数据分析图，并应在Supplement中补充相关的验证性实验图片，具体如下图所示。
Figure A：
未处理组（Mock）与处理组（Treat）RNA聚合酶II分别与目的基因启动子调控区域A区域、D区域、G区域的结合。处理后RNA聚合酶II与A区域、G区域结合明显增加，D区域结合情况未有明显变化。
Figure B：
未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子1（TF1）分别与目的基因启动子调控区域A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况比较。未处理组（Mock）：转录因子1（TF1）与目的基因启动子调控区域A、B、G、H有结合，但与D、E、I区域有不明显的少量结合，且与C、F组不结合。处理组（Treat）：转录因子1(TF1)与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、G、H区域的结合经处理后明显的大量提升，且原本不结合的C、F区域处理后有少量结合，对D、E、I区域的结合情况无明显改变。
Figure C：
未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子2（TF2）分别与目的基因启动子调控区域A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况。未处理组（Mock）：转录因子2（TF2）与目的基因启动子调控区域G、H有明显结合，与A、B、C、I区域有少量的结合，且与D、F组不结合。处理组（Treat）：转录因子2(TF2)与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、G、H区域的结合经处理后明显的大量提升，且与C、I区域的结合经处理后也有提升，与且原本不结合的D、F区域处理后有少量结合，对E区域的结合情况无改变。
Figure D：
未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子2（TF2）分别与目的基因启动子调控区域Chr1.3q4（1号染色体3q4座位）的区域：A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况。未处理组（Mock）：H3K7Ac（3号组蛋白7号赖氨酸位点乙酰化修饰蛋白）与目的基因启动子调控区域A,B C G、H有明显结合，与D、E、F、I区域有少量的结合。处理组（Treat）：H3K7Ac（3号组蛋白7号赖氨酸位点乙酰化修饰蛋白）与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、C、G、H、I区域的结合经处理后明显的大量提升，且与D、E区域的结合经处理后也有少量提升。
Supplement：
A 预实验：WB检测转录因子在细胞核内表达
B 细胞核抽提物被经过超声波打断或核酸酶酶解后DNA电泳，表示基因组DNA被打断成500bp左右的片段，方便后续的免疫共沉淀实验。
C ChIP-qPCR实验后，体系内的DNA片段扩增物进行DNA电泳，检测qPCR扩增产物是否和设计相符，以及检测是否有引物二聚体产生影响实验。
