RNA结合蛋白免疫沉淀技术 RIP

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实验常见问题

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结果分析

      对于一幅RIP-qRT-PCR实验结果Figure,应包含位点作用示意图、qRT-PCR结果数据分析图,并应在Supplement中补充相关的验证性实验图片,具体如下图所示。

RIP model figure

      RNA与蛋白绑定结合位点。经过一定处理,RNA原本以双链茎环结构,不结合RBP蛋白和miRNA,经过处理后茎环结构打开,一条链结合RBP,另外一条链结合miRNA和RISC。

 

      Figure A:

      某基因的引物设计位点。

RIP model figure A


      Figure B:

      上图:RNA结合蛋白,与未处理(Mock)组比较经过处理(Treat)后位点1、2结合量明显大量增加;下图:RBP IP组,阴性对照组Mock IgG IP,阳性对照组SNRNP70 IP。

RIP model figure B


      Supplement:

      WB检测RNA结合蛋白的表达。

RIP model figure S.A

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