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IL-6R/STAT3/miR-34a feedback loop promotes EMT-mediated colorectal cancer invasion and metastasis
日期:2017-09-13 标签:转录抑制
转录抑制机制研究案例(三)
一、调控通路
本文描述的是在细胞因子IL-6刺激下,IL-6受体(IL-6R)激活转录因子STAT3使其结合到MIR34A基因上,STAT3结合到基因上会阻碍基因的转录使miR-34a表达降低;在DOX处理细胞后,miR-34a表达量升高时,这时miR-34a与IL-6R Mrna的3’UTR结合抑制IL-6R蛋白的表达,从而使STAT3不能结合到MIR34A基因上抑制其表达,形成了一种调控循环回路。
二、实验流程
作者首先通过用IL-6处理细胞后检测EMT相关基因的mRNA表达,然后对STAT3和IL-6受体(IL-6R)敲低后检测细胞的侵袭说明IL-6诱导STAT3和IL-6R影响细胞的侵袭;用IL-6处理细胞后检测miR-34a初始转录本和成熟体的表达,并且用STAT3抗体进行ChIP实验获取与STAT3结合的DNA片段说明IL-6通过促进STAT3结合到MIR34A基因上抑制mir-34a的转录表达;为了验证IL-6R的3’-UTR与miR-34A的关系,作者进行了荧光素酶实验,表明miR-34a与IL-6R的3’-UTR互作抑制mRNA的翻译表达;对STAT3和IL-6R敲低后检测STAT3、IL-6R、miR-34a初始转录本和成熟体的表达,miR-34a表达后检测STAT3和IL-6R的表达,表明STAT3与IL-6R是正相关的,STAT3、IL-6R与miR-34a是负相关;作者最后进行细胞功能实验,对STAT3和IL-6R敲低细胞进行细胞侵袭、转移、小鼠体内成瘤等实验研究STAT3、IL-6R的功能。
三、核心FIGURE
Figure1说明的是IL-6诱导转录因子STAT3结合到MIR34A基因上抑制miR-34a的转录表达。
A、 用细胞因子IL-6处理细胞后检测miR-34a的初始转录本和成熟体,表明IL-6处理后miR-34a的初始转录和成熟体都降低。说明IL-6使MIR34A基因转录降低。
B、 用细胞因子IL-6处理HT-29和MCF7两种细胞后检测miR-34a成熟体,表明IL-6处理后,细胞的miR-34a表达均下降。
C、 CHIP实验,用细胞因子IL-6处理细胞后用STAT3抗体获取与转录因子STAT3结合的DNA片段,然后进行q-pcr检测,表明IL-6处理后STAT3结合到MIR34A基因上升。
D、构建STAT3敲低细胞株,然后用IL-6处理细胞后检测miR-34a的初始转录本,表明IL-6处理后转录降低,而STAT3敲低细胞IL-6处理后转录降低的程度明显低于未敲低细胞。
Figure2说明的是miR-34a与IL-6R mRNA的3’UTR结合抑制IL-6R蛋白的表达。
A、IL-6R的3’-UTR与miR-34结合位点的预测。
B、 对IL-6R的3’-UTR与miR-34结合位点进行突变后连接到荧光素酶报告质粒上,与miR-34共转染人源HCT116细胞,然后检测荧光素酶活性表明miR-34能与IL-6R的3’-UTR互作抑制荧光素酶活性,而结合位点突变后抑制作用降低。
C、将IL-6R的3’-UTR序列连接到荧光素酶报告质粒上,与miR-34共转染小鼠细胞,同样证明了miR-34与IL-6R的3’-UTR互作抑制荧光素酶活性。
Figure3说明的是miR-34a抑制STAT3和IL-6R,STAT3和IL-6R则是相互促进的关系。
A、分别对STAT3和IL-6R敲低后检测STAT3和IL-6R等蛋白的表达和miR-34a的初始转录本的表达,表明STAT3敲低后IL-6R的表达降低,IL-6R敲低后STAT3表达降低,而STAT3和IL-6R敲低后都使miR-34a的初始转录升高。
B、将miR-34a初始转录序列进行表达后检测成熟的miR-34a的表达,表明miR-34A成熟体升高。
C、 将miR-34a初始转录序列进行表达后检测细胞的侵袭能力,表明miR-34的表达使细胞侵袭能力下降。
D、将miR-34a初始转录序列进行表达后检测STAT3、IL-6R等蛋白的表达,表明miR-34的STAT3、IL-6R等蛋白的表达具有抑制作用。
本公司可提供的技术服务
本公司可进行以上类似实验的实验设计及整体实验外包项目,包括Q-PCR、Western Blot、Luciferase检测、CHIP、慢病毒稳转株的建立(过表达/敲低),其中的Luciferase检测、CHIP为本公司主营项目。
一、 CHIP技术:主要研究蛋白与基因之间的关系。
作者首先用细胞因子IL-6处理细胞后用STAT3抗体获取细胞中与STAT3蛋白结合的DNA片段然后用MIR34A基因引物进行q-pcr检测,表明IL-6处理后细胞中STAT3结合到MIR34A基因增加。
二、Luciferase检测:验证microRNA与靶标3’-UTR的互作。
分别将IL-6R mRNA的3’-UTR序列和突变序列连接到荧光素酶报告载体上,与miR-34共转染细胞,然后检测荧光素酶活性,表明miR-34通过IL-6R的3’-UTR抑制荧光素酶活性。
参考文献:Matjaz Rokavec,Meryem Gülfem Öner,Huihui Li,et al.IL-6R/STAT3/miR-34a feedback loop promotes EMT-mediated colorectal cancer invasion and metastasis[J]. J Clin Invest,2014,124(4):1853–1867
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