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Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans
日期:2016-04-19 标签:lncRNA-HEIH,EZH2
lncRNA HEIH与蛋白EZH2互作
文章研究思路
核心Figure
Figure说明:Figure主要阐述的是lncRNA HEIH与蛋白EZH2的相互作用。A:RIP实验。利用EZH2抗体,在Huh-7细胞和HCCLM3细胞中,钓取与蛋白EZH2结合的lncRNA,qPCR检测,结果证实蛋白EZH2与lncRNA HEIH有相互作用(Ab-1和Ab-2为lncRNA HEIA的两个检测位点)。B:将A图结果数据化。 C:利用RIP实验验证蛋白actin和AK055007与lncRNA HEIA无相互作用,作为A图对照。D:作为A图的反向验证,用RNA pull down验证lncRNA HEIH与蛋白EZH2有相互作用。E:利用RNA pull down进一步验证蛋白EZH2与 lncRNA HEIH结合区域。
我们公司可以提供的技术服务
一、RIP
RIP(RNA 免疫共沉淀)技术,主要研究蛋白与RNA的相互作用,主要原理是利用特定的蛋白抗体,在全蛋白提取液中捕获特定蛋白,特定蛋白含有与之结合的RNA,洗脱RNA,反转录,qPCR检测。我公司在实验体系中设置阳性及阴性对照,进一步排除系统误差。
二、RNA pull down
RNA pull down技术,主要研究lncRNA与蛋白的相互作用,主要原理是体外转录生物素标记的RNA,标记有生物素的RNA吸附到链霉亲和磁珠上,RNA与全蛋白提取液孵育,捕获互作的蛋白,后续进行银染-质谱或Western检测。我公司在实验体系中同时提供lncRNA正义链与反义链的pull down。
三、预测lncRNA与蛋白互作位点
通过相关的预测软件预测lncRNA的结合位点,根据结合位点设计实验方案,利用RNA pull down实验,进一步验证蛋白与lncRNA的结合区域。
原文链接:Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans (提取码:21b3)
来源:360云盘
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