技术服务
技术专题
联系我们
广州赛诚生物科技有限公司
广州市天河区黄埔大道中124号2705室
电话:020-29031124
手机:18102256923
Email:servers@gzscbio.com
Fax:020-85625352
QQ:2913120624
广州市天河区黄埔大道中124号2705室
电话:020-29031124
手机:18102256923
Email:servers@gzscbio.com
Fax:020-85625352
QQ:2913120624
RNA pull- down实验常见问题
问题1:RNA 降解
可能原因:1)无核酸酶的环境被破坏
2)体外转录的RNA探针降解
解决办法:1)清洗和使用新开的离心管和试剂等
2)RNA探针合成后,电泳检测其长度和浓度
问题2:RNA结合蛋白的亲和力不够:
可能原因:1)结合缓冲环境没有优化
2)裂解不完全
3)磁珠用量不足
4)RNA探针用量不足
解决办法:1)优化孵育时间、温度 、盐浓度等条件
2)增加裂解液和蛋白上样量的比例
3)增加裂解液
4)增加磁珠用量
5)增加探针用量
6)确定生物素和链霉亲和素效率
问题3:RNA结合蛋白没有结合
可能原因:1)靶蛋白量不足
2)缓冲体系不对
3)RNA探针和蛋白的亲和力本来就低
解决办法:1)增加上样蛋白量
2)应用低盐体系
3)加入交联试剂
问题4:结合的非特异性高
可能原因:1)缓冲环境没有优化
2)缓冲环境严谨性低
3)样品没有裂解完全和裂解体系没有优化
解决方法:1)优化孵育时间温度 盐浓度等条件
2)使用严谨性高的缓冲体系
3)调低RNA探针和样品的比例
4)提高裂解液的量
问题5:WB信噪比高
可能原因:1)阳性信号率低
2)一抗效率低
3)蛋白没有充分溶解
解决方法:1)增加二抗的量
2)用敏感度的化学发光液
3)用细胞裂解液预孵一抗
4)增加样品的量
5)确定有没有其他可能的结合情况
6)增加裂解液用量
目录浏览