实验相关产品

实验技术流程

点击 这里 链接至技术文章《ChIP实验技术流程》。

实验常见问题

点击 这里 链接至技术文章《ChIP实验常见问题》

结果分析

对于一幅ChIP-qPCR实验结果Figure，应包含位点作用示意图、qPCR结果数据分析图，并应在Supplement中补充相关的验证性实验图片，具体如下图所示。

     Figure A：

      未处理组（Mock）与处理组（Treat）RNA聚合酶II分别与目的基因启动子调控区域A区域、D区域、G区域的结合。处理后RNA聚合酶II与A区域、G区域结合明显增加，D区域结合情况未有明显变化。

      Figure B：

      未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子1（TF1）分别与目的基因启动子调控区域A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况比较。未处理组（Mock）：转录因子1（TF1）与目的基因启动子调控区域A、B、G、H有结合，但与D、E、I区域有不明显的少量结合，且与C、F组不结合。处理组（Treat）：转录因子1(TF1)与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、G、H区域的结合经处理后明显的大量提升，且原本不结合的C、F区域处理后有少量结合，对D、E、I区域的结合情况无明显改变。

      Figure C：

      未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子2（TF2）分别与目的基因启动子调控区域A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况。未处理组（Mock）：转录因子2（TF2）与目的基因启动子调控区域G、H有明显结合，与A、B、C、I区域有少量的结合，且与D、F组不结合。处理组（Treat）：转录因子2(TF2)与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、G、H区域的结合经处理后明显的大量提升，且与C、I区域的结合经处理后也有提升，与且原本不结合的D、F区域处理后有少量结合，对E区域的结合情况无改变。

      Figure D：

      未处理组（Mock）与处理组（Treat）转录因子2（TF2）分别与目的基因启动子调控区域Chr1.3q4（1号染色体3q4座位）的区域：A区域、B区域、C区域、D区域、E区域、F区域、G区域、H区域、I区域的结合情况。未处理组（Mock）：H3K7Ac（3号组蛋白7号赖氨酸位点乙酰化修饰蛋白）与目的基因启动子调控区域A,B C G、H有明显结合，与D、E、F、I区域有少量的结合。处理组（Treat）：H3K7Ac（3号组蛋白7号赖氨酸位点乙酰化修饰蛋白）与目的基因启动子调控区域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有结合，且与A、B、C、G、H、I区域的结合经处理后明显的大量提升，且与D、E区域的结合经处理后也有少量提升。

      Supplement：

      A 预实验：WB检测转录因子在细胞核内表达

      B 细胞核抽提物被经过超声波打断或核酸酶酶解后DNA电泳，表示基因组DNA被打断成500bp左右的片段，方便后续的免疫共沉淀实验。

      C ChIP-qPCR实验后，体系内的DNA片段扩增物进行DNA电泳，检测qPCR扩增产物是否和设计相符，以及检测是否有引物二聚体产生影响实验。

• 1 . 基因表达调控概述
  • 1.1. 转录调控与转录激活
  • 1.2. 转录后调控
  • 1.3. miRNA与lncRNA
• 2 . 基因表达调控研究进展
• 3 . 基因表达调控研究方法
• 4 . 基因表达调控主要实验技术
  • 4.1. 染色质免疫沉淀技术 ChIP
  • 4.2. RNA结合蛋白免疫沉淀技术 RIP
  • 4.3. RNA pull-down
  • 4.4. DNA pull-down
  • 4.5. 荧光素酶检测技术 Luciferase
  • 4.6. 凝胶迁移/电泳迁移率实验 EMSA