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广州赛诚生物科技有限公司
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CRISPR-Cas9基因敲入
Cas9基因敲入(knock in)
图1基因敲入原理图
-、概要
1. 设计sgRNA-Cas9及修复DNA模版
2 .构建sgRNA-Cas9质粒及修复DNA模板质粒
3 .将sgRNA-Cas9、修复DNA模版共转293T细胞
4. 嘌呤筛选,检测荧光
5 .PCR检测基因组,RFP蛋白是否敲入
针对人类AAVS1 AAVS1 Safe Harbor基因设计了sgRNA进行软件分析以确保sgRNA没有预测的脱靶结合位点。设计DNA修复模版,两侧同源臂,其两侧各有600bp的同源臂。
将选定的sgRNA设计与CMV启动子驱动的Cas9基因一起克隆到pCas-Guide中以制备pCas-Guide-AAVS1(图2)
将DNA修复模板插入含有RFP-嘌呤霉素的pAAVS1-RFP-DNR表达载体(图2)。
图2 sgRNA-Cas9质粒及修复DNA模版质粒
用lipofectmine2000转染试剂将上述两种质粒转染至293T细胞。
4. 嘌呤筛选,检测荧光
嘌呤筛选3-4周
3-4周后,> 95%的HEK293细胞表达RFP(图3)。
图3 荧光检测图片 A转染筛选后明场图片 B转染筛选后荧光图片 C未转染加嘌呤筛选细胞
为了证实在基因组DNA中敲入RFP,设计引物对,引物1靶向RFP上游的5'同源臂和靶向RFP-嘌呤霉素基因内的引物2。
1.1kb的PCR产物表明在AAVS1位点敲入成功; 没有PCR扩增指示敲入不成功(图4)。
在对照细胞('WT细胞')中没有看到PCR扩增。
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