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Transcriptional and Epigenetic Regulation of KIF14 Overexpression in Ovarian Cancer
日期:2017-08-23 标签:Transcriptional,and,Epigenetic,Regulation,of,KIF14,Overexpression,in,Ovarian,Cancer
DNA甲基化研究案例(一)
一、调控通路
在正常细胞中,为了维持平衡,KIF14基因启动子的DNA是以甲基化状态存在;当细胞发生癌变时,转录因子SP1和YY1结合到KIF14基因启动子上促使DNA去甲基化从而促进KIF14的表达。另外,本文还简单的表明了miR-382抑制KIF14的表达。
二、实验流程
作者首先通过荧光素酶活性实验说明了转录因子SP1、YY1的KIF14启动子活性的影响,然后建立SP1和YY1敲低细胞株检测KIF14的表达;为了进一步验证SP1、YY1与KIF14启动子的关系,作者先用CHIP实验验证了SP1、YY1与启动子的结合,然后通过甲基化PCR实验说明SP1和YY1促使KIF14启动子的DNA去甲基化;最后作者通过检测KIF14高表达/低表达细胞中microRNA的表达和microRNA敲低后的KIF14 Mrna的表达简单的说明miR-382抑制KIF14 mRNA的表达。
三、核心FIGURE
Figure1说明的是转录因子SP1和YY1与KIF14启动子互作影响该基因的表达。
A、 启动子荧光素酶活性实验,表明转录因子SP1和YY1影响KIF14启动子活性。
B、 Qpcr检测转录因子SP1和YY1敲低后KIF14 mRNA的表达,表明SP1和YY1敲低后KIF14 mRNA水平下降。
C、 WB检测转录因子SP1和YY1敲低后KIF14蛋白的表达,明SP1和YY1敲低后KIF14蛋白水平下降。
Figure2说明的是转录因子SP1和YY1结合到KIF14启动子上促进DNA去甲基化。
A、 CHIP实验,分别用转录因子蛋白SP1和YY1抗体钓取结合的DNA片段,然后进行Q-PCR检测,结果表明肿瘤细胞的SP1和YY1与KIF14启动子高度结合。
B、 甲基化分析,用甲基化特异引物进行q-PCR检测正常细胞和肿瘤细胞的KIF14启动子DNA甲基化情况,结果表明肿瘤细胞去甲基化程度上升。
Figure3说明的是miR-382抑制KIF14的表达。
A、Q-PCR检测KIF14高表达和低表达细胞的microRNA,筛选出几个差异表达的microRNA。
B、通过对micro的抑制检测KIF14 mRNA的表达情况,结果表明miR-382受抑制后KIF14 mRNA表达上升,说明miR-382可抑制KIF14的表达。
本公司可提供的技术服务
本公司可进行以上类似实验的实验设计及整体实验外包项目,包括Q-PCR、Western Blot、Luciferase检测、CHIP、慢病毒稳转株的建立(过表达/敲低),其中的Luciferase检测、CHIP为本公司主营项目。
一、 Luciferase检测:
作者分别将YY1、HSF1、SP1表达载体与KIF14启动子荧光素酶载体转染细胞,然后检测荧光素酶活性。
二、 CHIP技术:主要研究蛋白与基因启动子之间的关系。
作者分别用SP1和YY1抗体钓取细胞中与蛋白结合的DNA片段,然后进行Q-PCR验证,表明肿瘤细胞的SP1和YY1与KIF14启动子高度结合。
参考文献:Brigitte L.The ´riault,Halesha D.Basavarajappa, Harvey Lim,et al.Transcriptional and Epigenetic Regulation of KIF14 Overexpression in Ovarian Cancer[J].PLoS ONE,2014,9(3):e91540.
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