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基因表达调控实验技术

基因表达调控实验技术

     基因表达调控一般分为转录前的调控、转录过程的调控和转录后调控。转录前的调控包括基因组DNA的修饰和组蛋白的修饰,这里可能涉及到修饰酶与启动子互作、LncRNA与修饰酶与启动子的互作,可以通过CHIP、RIP、co-IP、RNA pull down、DNA pull-down等实验技术进行验证;转录过程的调控包括转录因子或转录抑制因子对基因启动子的作用,LncRNA与转录因子互作,LncRNA与基因互作等,这些可以通过启动子Luciferase活性、CHIP、RIP、CLIP、CHIRP、RNA pull down、DNA pull-down、DNA EMSA、RNA-蛋白FISH等实验技术进行验证;转录后调控包括LncRNA与mRNA互作、LncRNA与microRNA互作(ceRNA机制)、microRNA与mRNA互作、LncRNA与mRNA结合蛋白互作等,可通过3’-UTR Luciferase活性、RIP、CLIP、RNA pull down、RNA-RNA pull-down、RNA EMSA、RNA-蛋白FISH、RNA-RNA FISH等实验技术进行验证。对于一种RNA或蛋白参与的是基因表达调控哪个阶段,可以通过核质分离和FISH进行细胞的定位初步确定,位于细胞核的一般参与的是转录前和转录过程的调控,位于细胞质的一般参与转录后的调控。

下面我们将介绍在基因表达调控中所用到的一些关键的实验技术服务项目。

 

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1CHIP 染色质免疫沉淀技术

2RIP RNA结合蛋白免疫沉淀技术

3CHIRP 免疫共沉淀实验

4CLIP实验技术

5RNA pull-down

6DNA pull-down

7RNA-RNA pull-down

8Luciferase 荧光素酶实验

9DNA/RNA EMSA 凝胶电泳迁移实验

10FISH 免疫荧光原位杂交技术

11核质分离技术

 


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