CLIP实验技术

Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色质免疫沉淀，是一项体内研究RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其主要原理是基于RNA与其相应的RNA结合蛋白会在紫外照射下会发生共价结合，以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白复合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，进行qRT-PCR检测或测序分析。最近，这项技术也被应用于microRNA的靶标鉴定。

在CLIP实验过程中我们设置一系列的质控标准以确保每一步实验的真实有效，如WB验证抗体和蛋白表达、CLIP产物RT-PCR跑胶图。具体示例如下图所示：

      WB检测抗体的效果以及处理和未处理组细胞蛋白的表达。

CLIP实验产物可进行高通量测序或者进行dot blot检测。

• 1 . 基因表达调控
  • 1.1. 表观遗传修饰调控
  • 1.2. 转录水平调控
  • 1.3. 转录后水平调控
• 2 . 基因表达调控实验技术
  • 2.1. CHIP 染色质免疫沉淀技术
  • 2.2. RIP RNA结合蛋白免疫沉淀技术
  • 2.3. CHIRP 免疫共沉淀实验
  • 2.4. CLIP实验技术
  • 2.5. RNA pull-down
  • 2.6. DNA pull-down
  • 2.7. RNA-RNA pull-down
  • 2.8. Luciferase 荧光素酶实验
  • 2.9. DNA/RNA EMSA 凝胶电泳迁移实验
  • 2.10. FISH 免疫荧光原位杂交技术
  • 2.11. ​核质分离