RNA-RNA pull-down

RNA-RNA pull-down是检测RNA与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA-RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆提取液孵育，形成RNA-RNA复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过qRT-PCR实验检测特定的RNA是否与靶标RNA相互作用。

在RNA-RNA pull-down实验过程中我们设置一系列的质控标准以确保每一步实验的真实有效，如探针体外转录模板扩增跑胶、RNA探针跑胶检测、产物q-pcr跑胶图。具体示例如下图所示：

上图为RNA探针跑胶图，确保了探针的质量和用量基本一致。

RNA-RNA pull-down产物Qpcr检测后，体系内的RNA反转录片段扩增物进行DNA电泳，检测qPCR扩增产物是否和设计相符，以及检测是否有引物二聚体产生影响实验。

RNA-RNA pull-down实验结果为RNA产物的测序或q-pcr结果，下图为q-pcr结果示例：

RNA-RNA pull-down产物Qpcr检测后，体系内的RNA反转录片段扩增物进行DNA电泳，检测qPCR扩增产物是否和设计相符，以及检测是否有引物二聚体产生影响实验。

RNA-RNA pull-down实验结果为RNA产物的测序或q-pcr结果，下图为q-pcr结果示例：

• 1 . 基因表达调控
  • 1.1. 表观遗传修饰调控
  • 1.2. 转录水平调控
  • 1.3. 转录后水平调控
• 2 . 基因表达调控实验技术
  • 2.1. CHIP 染色质免疫沉淀技术
  • 2.2. RIP RNA结合蛋白免疫沉淀技术
  • 2.3. CHIRP 免疫共沉淀实验
  • 2.4. CLIP实验技术
  • 2.5. RNA pull-down
  • 2.6. DNA pull-down
  • 2.7. RNA-RNA pull-down
  • 2.8. Luciferase 荧光素酶实验
  • 2.9. DNA/RNA EMSA 凝胶电泳迁移实验
  • 2.10. FISH 免疫荧光原位杂交技术
  • 2.11. ​核质分离