CHIP-seq RNA-seq 产品主页
circRNA建库与分析流程
circRNA 如何预测其靶基因?
lncRNA如何预测其靶基因?
lncRNA建库与分析流程
micRNA建库与分析流程
motif结果能给到我们些什么信息?
mRNA实验建库流程与分析流程(polyA 建库)
Enhancer 与 Super-enhancers
组蛋白(Histone)是什么? 组蛋白是真核生物体细胞染色质与原核细胞中的碱性蛋白质,和DNA共同组成核小体结构。它们是染色质的主要蛋白质组分,作为DNA缠绕的线轴,并在基因调控中发挥作用。
对于ChIP-seq实验,我们从比对文件中观察到的是链的不对称性,其中+/-链上的读取密度位于结合位点的中心。所选片段的5'末端将在正链和负链上形成基团。然后使用统计方法评估这些组的分布,并与背景(输入或模拟IP样本)进行比较,以确定富集位点是否可能是真实的结合位点。
我们的Peak是如何找出来的?
ChIP-Seq技术包括两部分:建库和测序,建库和测序的质量对于后续分析尤为关键,但是建库前ChIP实验的设计也同样重要
比较ChIP-seq的差异获得的不同数据
功能富集分析可以将成百上千个基因、蛋白或者其他分子分到不同的通路中,以减少分析的复杂度。
miRNA如何预测其靶基因? miRNA是一类在生物体内起到重要调控作用的的小片段非编码RNA。一般认为miRNA通过和mRNA的结合,可以抑制mRNA的表达,从而影响到Gene的表达。
转录因子与DNA结合位点预测